Andrea Iannone (Ducati Team) a réalisé le meilleur chrono à la fin de la troisième séance d'essais, samedi matin. Son coéquipier Andrea Dovizioso, leader de la veille, a été relégué en septième position (+de 0.843s).
Maverick Viñales (Team Suzuki Ecstar), toujours parmi les hommes de tête depuis le début du week-end, a conservé la troisième position (+0.428s) tandis que Jorge Lorenzo (Movistar Yamaha ) passait de la huitième à la quatrième position, juste devant son coéquipier Valentino Rossi.
Dixième vendredi, Marc Márquez (Repsol Honda) a lourdement chuté en milieu de séance et s’est luxé l’épaule gauche en manquant de peu de percuter son coéquipier Dani Pedrosa. Même si elle lui a valu un passage à l'hopital le plus proche pour un contrôle, cette blessure ne devrait pas remettre en cause sa participation à la suite du week-end, mais pourrait jouer sur les performances du jeune Espagnol. Il termine prématurement cette séance en neuvième position mais échappera à la Q1 tout comme Pedrosa qui se classe dixième.
Résultats de la troisième séance d'essais du Grand Prix d'Autriche / Red bull Ring :
Samedi 13 août 2016
| 1 | 29 | Andrea IANNONE | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'23.327 | ||
| 2 | 25 | Maverick VIÑALES | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'23.755 | 0.428 / 0.428 | |
| 3 | 99 | Jorge LORENZO | SPA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'23.843 | 0.516 / 0.088 | |
| 4 | 45 | Scott REDDING | GBR | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 1'23.962 | 0.635 / 0.119 | |
| 5 | 46 | Valentino ROSSI | ITA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'24.026 | 0.699 / 0.064 | |
| 6 | 41 | Aleix ESPARGARO | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'24.108 | 0.781 / 0.082 | |
| 7 | 4 | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'24.170 | 0.843 / 0.062 | |
| 8 | 8 | Hector BARBERA | SPA | Avintia Racing | Ducati | 1'24.170 | 0.843 | |
| 9 | 93 | Marc MARQUEZ | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 1'24.265 | 0.938 / 0.095 | |
| 10 | 26 | Dani PEDROSA | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 1'24.422 | 1.095 / 0.157 | |
| 11 | 9 | Danilo PETRUCCI | ITA | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 1'24.632 | 1.305 / 0.210 | |
| 12 | 50 | Eugene LAVERTY | IRL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 1'24.692 | 1.365 / 0.060 | |
| 13 | 51 | Michele PIRRO | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'24.722 | 1.395 / 0.030 | |
| 14 | 35 | Cal CRUTCHLOW | GBR | LCR Honda | Honda | 1'24.768 | 1.441 / 0.046 | |
| 15 | 68 | Yonny HERNANDEZ | COL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 1'24.815 | 1.488 / 0.047 | |
| 16 | 19 | Alvaro BAUTISTA | SPA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 1'24.821 | 1.494 / 0.006 | |
| 17 | 38 | Bradley SMITH | GBR | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 1'25.003 | 1.676 / 0.182 | |
| 18 | 44 | Pol ESPARGARO | SPA | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 1'25.005 | 1.678 / 0.002 | |
| 19 | 43 | Jack MILLER | AUS | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 1'25.016 | 1.689 / 0.011 | |
| 20 | 53 | Tito RABAT | SPA | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 1'25.278 | 1.951 / 0.262 | |
| 21 | 6 | Stefan BRADL | GER | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 1'25.447 | 2.120 / 0.169 | |
| 22 | 76 | Loris BAZ | FRA | Avintia Racing | Ducati | 1'25.552 | 2.225 / 0.105 |
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